1、 核酸定量分析 對傳染性ji 病進行定量定性分析，病原微生物或病毒含量的檢測 , 比如近期流行的甲型H1N1流感， 轉(zhuǎn)基因動植物基因拷貝數(shù)的檢測，RNAi 基因失活率的檢測等。
2 、基因表達差異分析 比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達差異 ( 如藥wu處理、物理處理、化學(xué)處理等 ) ，特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA芯片或差顯結(jié)果的確證
3 、SNP 檢測 檢測單核苷酸多態(tài)性對于研究個體對不同ji 病的易感性或者個體對特定藥wu的不同反應(yīng)有著重要的意義，因分子信標結(jié)構(gòu)的巧妙性，一旦SNP 的序列信息是已知的，采用這種技術(shù)進行高通量的 SNP 檢測將會變得簡單而準確。
4、 甲基化檢測 甲基化同人類的許多ji 病有關(guān)，特別是癌癥， Laird 報道了一種稱作 Methylight的技術(shù)，在擴增之前先處理 DNA ，使得未甲基化的胞嘧啶變成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不受影響，用特異性的引物和 Taqman探針來區(qū)分甲基化和非甲基化的 DNA ，這種方法不僅方便而且靈敏度更高。