RNA提取方法是Trizol法。整個過程需要佩戴口罩和手套,用的EP管和移液管槍頭都是RNAseFree的,也就是不含RNA酶的,因為RNA酶到處都有,可隨時講解提出的RNA。
一、細(xì)胞準(zhǔn)備
我本次用的是PC-3細(xì)胞(一種前列腺癌細(xì)胞系),將細(xì)胞種于6孔板(分組情況根據(jù)情況設(shè)定)。待細(xì)胞長滿后,用適量PSB洗兩次,然后將殘留的PBS吸干凈。如果怕吸不干凈,可將6孔板倒扣在吸水紙上,空干。
二、加入Trizol
將Trizol分別加入到6孔板中,每孔1mL,吹打充分裂解細(xì)胞后,將漿液轉(zhuǎn)移至1.5mL的EP管中(用不含RNA酶的EP管),靜置5分鐘后,4℃ 12000g離心5分鐘,將上清轉(zhuǎn)移至新的EP管中。
注:TRIZOL的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,TRIzol中的8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇可以抑制內(nèi)源和外源RNA酶。
三、加入氯仿
加入1/5體積Trizol的氯仿(CHCl3),我用了1mLTizol,因此這里加入了200μL的氯仿。加入氯仿后,上下翻轉(zhuǎn)混均勻,室溫下靜置5分鐘,12000g4℃離心15分鐘,然后將上清液轉(zhuǎn)移至新的EP管中(抽取過程要輕柔,避免將中間的白色沉淀抽入)。
注:氯仿是良好的有機(jī)溶劑,可以將有機(jī)相和無機(jī)相分離,被trizol裂解的細(xì)胞各種結(jié)合了酚的蛋白質(zhì)會被溶解在下層的有機(jī)相中,而RNA則在上層的無機(jī)相中。
三、加入異丙醇
加入0.5~1倍Trizol體積的異丙醇,本次我加入了500μL的異丙醇,震蕩后室溫靜置5分鐘,然后12000g4℃離心15分鐘,保留沉淀,棄上清。
這一部分目的是將RNA沉淀。
四、加入75%的乙醇
向沉淀中加入與Trizol等體積的75%的乙醇,本次加入1ml乙醇,然后7500g4℃離心5分鐘,棄上清,保留沉淀,降EP管倒扣在吸水紙上,盡量干燥。
注:這里用的乙醇是用DEPC水與無水乙醇配置的。此步驟的目的是將沉淀的RNA洗干凈。
五、加入DEPC水中溶解
將沉淀溶解于DEPC水中,一般加入30~100μL的DEPC水,可用槍頭吹打,促進(jìn)RNA的溶解,完成整個RNA的提取。再可將樣品保存在-20℃或-80℃。