實時熒光定量PCR (real-time quantitative polymerase chain reaction,Real-time qPCR),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進行定量分析的方法。
PCR反應(yīng)條件的控制:
1. PCR反應(yīng)的緩沖液提供合適的酸堿度與某些離子 。
2. 鎂離子濃度 總量應(yīng)比dNTPs的濃度高,常用1.5 mmol/L。
3. 底物濃度dNTP以等摩爾濃度配制,20~200 umol/L。
4. TaqDNA聚合酶2.5U(100 ul)。
5. 引物 濃度一般為0.1 ~0.5 umol/L。
6. 反應(yīng)溫度
(1)變性溫度和時間95℃,30 s。
(2)退火溫度和時間 低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃。
(3)延伸溫度和時間72℃,1 min/kb(10 kb內(nèi))。
(4)Tm值=4(G+C) +2(A+T)
7. 循環(huán)次數(shù) :一般為25 ~30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴增的產(chǎn)量。模板初始濃度低,可增加循環(huán)數(shù)以便達到有效的 擴增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的。一般循環(huán)數(shù)為30個左右,循環(huán)數(shù)超過30個以后,DNA聚合酶活性逐漸達到飽和,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,出現(xiàn)了所謂的“平臺期"。